Ông là con trai thứ hai của Khâm Minh Thiên hoàng, mẹ là Hoàng hậu Thạch Cơ hoàng nữ (石姬皇女; いしひめのひめみこ), con gái Tuyên Hóa Thiên hoàng và Tachibana no Nakatsu.

Theo các sách Nhật Bản Thư Kỷ và Ngu Quản Sao, Mẫn Đạt Thiên hoàng có 4 phi tử và 16 người con, 6 hoàng tử và 10 hoàng nữ.[5]

Hoàng hậu đầu tiên của Bidatsu là Quảng Cơ (廣姬), qua đời trong năm thứ 5 dưới triều đại của ông. Để thay thế, ông lựa một trong các thứ phi của ông là Ngạch Điền Bộ hoàng nữ (額田部皇女), phong làm Hoàng hậu. Ngạch Điền Bộ hoàng nữ vốn là con gái thứ của Khâm Minh Thiên hoàng, theo vai vế là em cùng cha khác mẹ của Mẫn Đạt Thiên hoàng. Sau đó, Hoàng nữ nối ngôi Hoàng hậu và ngày nay được gọi là Thôi Cổ Thiên hoàng.

Mặc dù có khá nhiều người con, nhưng không một ai trong số đó trở thành Thiên hoàng[6]. Sau khi ông mất, hai người em của ông là Dụng Minh Thiên hoàng và Sùng Tuấn Thiên hoàng kế vị.

• Hoàng hậu: Quảng Cơ (廣姬, ひろひめ), con gái của Hoàng tử Mate no Okinaga (息長真手王); Hoàng hậu năm 572, mất năm 575; có ba người con:
  • Hoàng nữ Sakanobori, Nghịch Đăng hoàng nữ (逆登皇女, さかのぼりのひめみこ).
  • Hoàng nữ Uji no Shitsukahi, Thố Đạo hoàng nữ (菟道皇女, うじのひめみこ).
  • Hoàng tử Oshisako no Hikohito no Oe (押坂彦人大兄皇子, おしさかのひこひとのおおえのみこ), sinh vào năm 556, kết hôn với Khang Thủ Cơ hoàng nữ (糠手姫皇女), là em gái của ông, con gái của Mẫn Đạt Thiên hoàng và Thái nữ Thố Danh Tử (菟名子). Vợ thứ là Tiểu Khẩn Điền hoàng nữ (小墾田皇女), chị em cùng cha khác mẹ, mẹ là Ngạch Điền Bộ hoàng nữ. Thứ nữa là Diên Tỉnh Cung Trương hoàng nữ (桜井弓張皇女), chị em cùng cha khác mẹ và là em ruột cùng mẹ với Tiểu Khẩn Điền hoàng nữ. Một thứ thiếp là Đại Ngũ Vương (大俣王). Hoàng tử có các người con gồm:
    • Vương tử Chinu (茅渟王, ちぬのみこ), sinh vào năm 575, kết hôn với Cát Bị Cơ vương (吉備姫王), có một người con trai và một người con gái: Bảo hoàng nữ (宝皇女) và Kinh hoàng tử (輕皇子).
    • Vương tử Tamura (田村王, たむらのみこ), sau là Thư Minh Thiên hoàng.
• Hoàng hậu: Ngạch Điền Bộ hoàng nữ, con gái của Khâm Minh Thiên hoàng và Kiên Diêm viện (堅鹽媛, きたしひめ); có tám người con:
  • Hoàng nữ Uji no Shitsukahi, Thố Đạo Bối Sao hoàng nữ (菟道貝鮹皇女, うじのかいたこのひめみこ), sinh vào năm 570, kết hôn với Thánh Đức Thái tử, con trai của Dụng Minh Thiên hoàng.
  • Hoàng tử Takeda (竹田皇子, たけだのみこ).
  • Hoàng nữ Woharida, Tiểu Khẩn Điền hoàng nữ (小墾田皇女, おはりたのひめみこ), sinh vào năm 572, kết hôn với anh em cùng cha khác mẹ là Oshisako no Hikohito no Oe.
  • Hoàng nữ Karu no Mori, Lô Tư Thủ hoàng nữ (鸕鶿守皇女, うもりのひめみこ).
  • Hoàng tử Katsuragi (葛城王, かずらきのみこ).
  • Hoàng tử Wohari (尾張皇子, おわりのみこ).
  • Hoàng nữ Tame, Điền Nhãn hoàng nữ (田眼皇女, ためのひめみこ), kết hôn với cháu trai là Dụng Minh Thiên hoàng.
  • Hoàng nữ Sakurawi no Yumihari, Diên Tỉnh Cung Trương hoàng nữ, (桜井弓張皇女, さくらいのゆみはりのひめみこ), kết hôn với anh em cùng cha khác mẹ là Oshisako no Hikohito no Oe.
• Phu nhân: Lão Nữ Tử (老女子, おみなご), con gái của Kasuga no Nakatsu Kimi no Omi; có bốn người con:
  • Hoàng tử Naniha (難波皇子, なにわのみこ).
  • Hoàng tử Kasuga (春日皇子, かすがのみこ).
  • Hoàng nữ Kuwada, Tang Điền hoàng nữ (桑田皇女, くわたのひめみこ).
  • Hoàng tử Ohomata (大派皇子, おおまたのみこ).
• Thái nữ: Thổ Danh Tử (菟名子, うなこ), con gái của Ohoka no Obito no Okuma; có hai người con:
  • Hoàng nữ Futohime, Thái Cơ hoàng nữ (太姫皇女, ふとひめのみこ).
  • Hoàng nữ Nukatehime, Khang Thủ Cơ hoàng nữ (糠手姫皇女, ぬかでひめのみこ), sinh vào năm 570, kết hôn với anh em cùng cha khác mẹ là Hoàng tử Oshisako no Hikohito no Oe.